A la suite d'actes et de violences verbales et physiques entre élèves ou auprès d'enseignants, le département de l'instruction publique s'est doté dès février 2005 d'un plan de lutte contre la violence en milieu scolaire. Il se base sur 5 piliers : prévention, participation, partenariat, médiation et sanction. Ce plan est issu de travaux faits à Genève et à l'étranger. En outre, il valorise et développe les mesures déjà prises dans les écoles du canton.
Permettre de maintenir ou rétablir un climat d'établissement serein et propice aux apprentissages au sein de tous les établissements des différents degrés d'enseignement. La réalisation de cet objectif implique la mise en place de dispositifs et d'actions ciblées relevant de la prévention, de la participation, du partenariat, de la médiation et de la sanction.
2005 : Etablissement d'un «Cadre général relatif à l'application des sanctions prévues par les règlements à l'encontre des élèves» (voir la deuxième annexe du Rapport du Conseil d'Etat au Grand Conseil sur la motion 1420). et actualisation des directives à l'intention des responsables d'établissements. Signature d'un protocole de collaboration et d'intervention entre les établissements scolaires publics genevois et la police cantonale pour assurer une collaboration régulière. Ce dispositif permet d'anticiper la résolution de problèmes ou de les gérer de manière adéquate.
2007 : Début du recensement des actes de violence dans les établissements (SIGNA) Diffusion d'un mémento à l'usage des parents et de leurs enfants.
2008 : Emission d'une procédure relative au «Soutien apporté aux membres du personnel victimes de violence par des élèves ou d'autres usagers, dans l'exercice de leur fonction».
2009 : généralisation des conseils d'établissement.
2010 : mise en place d'un conseil de discipline
Participation du canton de Genève au programme national de prévention et de lutte contre la violence des jeunes 2011-2015.