Le Service du Protocole assure pour l'Etat la permanence et la qualité de ses relations avec les différentes autorités de la Confédération, le monde diplomatique et consulaire, ainsi que les organisations et institutions gouvernementales et non-gouvernementales internationales installées à Genève. Il veille à l'application des règles de préséance du canton et permet le bon déroulement protocolaire des manifestations officielles impliquant le Conseil d'Etat ou l'un de ses membres.
Plus de 2300 chefs d'Etat, ministres, ambassadeurs, consuls séjournent chaque année à Genève, soit dans le cadre de manifestations mondiales, soit pour participer à des sessions particulières des agences des Nations Unies.